Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms