Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Dnmt3bO88509 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnmt3bO88509 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dnmt3bO88509 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dnmt3bO88509 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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