Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms