Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lnx1O70263 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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