Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrxO55103 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrxO55103 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrxO55103 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms