Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnk2O54967 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms