Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3O54890 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms