Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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