Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Opn1mwO35599 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Opn1mwO35599 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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