Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Rnf5O35445 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf5O35445 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf5O35445 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms