Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xbp1O35426 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms