Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkd2O35245 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2O35245 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2O35245 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms