Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bhlhe40O35185 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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