Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcm2O09102 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms