Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra2O08842 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms