Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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BC117090L7N257 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC117090L7N257 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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