Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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