Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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