Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms