Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3336J3QMQ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3336J3QMQ6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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