Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms