Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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