Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20834J3QM72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20834J3QM72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20834J3QM72 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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