Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn2r6H3BK29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms