Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms