Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms