Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms