Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms