Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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