Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms