Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd7E9Q9W7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd7E9Q9W7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms