Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms