Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms