Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC030500E9Q6W0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms