Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pate1E9Q658 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate1E9Q658 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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