Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms