Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms