Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms