Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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