Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8994E9PV04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms