Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms