Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930455H04RikD3Z622 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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4930455H04RikD3Z622 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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