Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms