Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Phf11bB4XVQ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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