Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms