Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NhsB1AV60 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms