Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms