Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem235B1AQL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms