Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms