Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SetxA2AKX3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms